Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC188H7C350 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC188H7C350 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms