Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8W8V4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8W8V4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8W8V4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
F8W8V4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8W8V4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8W8V4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8W8V4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8W8V4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8W8V4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F8W8V4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
F8W8V4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8W8V4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8W8V4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8W8V4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8W8V4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8W8V4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8W8V4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8W8V4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F8W8V4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
F8W8V4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8W8V4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8W8V4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8W8V4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8W8V4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F8W8V4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F8W8V4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms