Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PATL2C9JE40 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PATL2C9JE40 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms