Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms