Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DGG1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DGG1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DGG1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DGG1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DGG1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DGG1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DGG1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DGG1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DGG1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DGG1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DGG1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DGG1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DGG1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DGG1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B4DGG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B4DGG1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B4DGG1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DGG1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DGG1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DGG1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DGG1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DGG1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DGG1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DGG1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DGG1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DGG1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DGG1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DGG1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DGG1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DGG1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DGG1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DGG1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DGG1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DGG1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DGG1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DGG1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DGG1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DGG1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms