Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2-AKAP2B1ALY0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms