Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BECN2A8MW95 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms