Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KNCNA6PVL3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms