Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
C5orf60A6NFR6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C5orf60A6NFR6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms