Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF316A6NFI3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
ZNF316A6NFI3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms