Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms