Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWA3AA6NCI4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms