Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMB4A4D0S4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMB4A4D0S4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms