Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms