Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBC2A0A5B9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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