Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRI6

CENPVL3, Centromere protein V-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3A0A0U1RRI6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPVL3A0A0U1RRI6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPVL3A0A0U1RRI6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms