Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQS6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQS6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms