Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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