Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0J9YY10 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0J9YY10 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0J9YY10 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0J9YY10 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0J9YY10 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0J9YY10 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms