Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms