Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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