Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EOMES-203ENST00000461503 2080 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEB3-201ENST00000361644 2305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC016590.1-205ENST00000612804 2303 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DCBLD2-202ENST00000326857 3959 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 APOL3-201ENST00000349314 2117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM8-206ENST00000608353 2111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UHRF2P1-201ENST00000431339 2387 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP4-213ENST00000489701 2396 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EIF1B-AS1-205ENST00000629723 2399 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PWP1-201ENST00000412830 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCID2-204ENST00000375459 1668 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCID2-206ENST00000375479 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL353611.2-201ENST00000625008 2897 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ETFDH-201ENST00000307738 1903 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GINS3-202ENST00000328514 1932 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CES5A-204ENST00000520435 1948 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CICP26-201ENST00000425003 2448 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SEZ6L2-203ENST00000350527 3173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MEF2D-202ENST00000360595 3194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LRTOMT-207ENST00000435085 3194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC010201.2-201ENST00000605595 1495 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms