Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms