Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms