Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms