Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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