Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRACR2AQ9BSW2 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms