Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms