Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.180-201ENST00000612546 322 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC246680.1-201ENST00000444624 494 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AL160408.6-201ENST00000632063 1257 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC103925.1-201ENST00000453155 771 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 LAIR1-217ENST00000474878 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SYNPR-AS1-201ENST00000488201 558 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.82-201ENST00000611637 265 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AP000346.1-201ENST00000390329 1087 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 FAM86B1-215ENST00000533513 725 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 TINF2-210ENST00000559019 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC109460.2-202ENST00000568057 573 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms