Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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