Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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