Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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