Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms