Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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