Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CTSLP1-201ENST00000457530 1002 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC245297.1-201ENST00000313342 933 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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