Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RPS29P62273 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms