Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFNP31947 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFNP31947 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFNP31947 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFNP31947 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFNP31947 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFNP31947 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFNP31947 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFNP31947 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFNP31947 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms