Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC026369.2-201ENST00000540136 1101 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GCAP28676 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GCAP28676 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms