Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
PGPEP1LA6NFU8 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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