Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 SLC22A18AS-201ENST00000455942 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP34Q70CQ2 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 OR10AA1P-201ENST00000417823 937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 CHIAP2-204ENST00000532686 1449 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP34Q70CQ2 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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