Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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