Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 RN7SL43P-201ENST00000463926 291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC069181.1-201ENST00000498256 554 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAPVD1Q14C86 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms