Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMTNP53814 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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