Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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