Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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