Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 CCDC148-203ENST00000409889 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CACNA1BQ00975 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 RNA5SP358-201ENST00000362973 117 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 GGNBP1-201ENST00000374458 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 HLA-DRA-201ENST00000374982 1169 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AL445070.1-201ENST00000414631 714 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 RN7SK-201ENST00000636484 328 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 LINC01515-201ENST00000433152 1339 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CHN2-209ENST00000421775 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AL355298.1-201ENST00000425391 180 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AC116049.1-201ENST00000505282 385 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AC079602.2-201ENST00000538389 283 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CACNA1BQ00975 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms