Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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