Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms