Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MLH1P40692 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MLH1P40692 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MLH1P40692 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms