Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GGCXP38435 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GGCXP38435 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms